ANÁLISIS DE DATOS DE METATAXONOMÍA CON R: DE RAW READS A HIGH-QUALITY PLOTS 

01/10/2024
Tipo
PDI.
Estado
Concluido.
Modalidad
Presencial.
Plazas
20
Fecha de inicio
01/10/2024
Fecha de finalización
02/10/2024
Horarios
De 11:00 a 14:00
Duración
6 horas
Destinatarios
PDI de la Universidad de León
Créditos de libre configuracion
0,6
Lugar y aulas de impartición
CRAI-TIC
Tasas de matrícula
Gratuita
Objetivos
Realizar y comprender el análisis completo, desde filtrado de calidad de lecturas hasta ploteo de resultados, de un estudio de secuenciación por amplicones de 16S rRNA (metataxonomía de bacterias). 
Metodología

Clases teórico-prácticas empleando un ordenador con el programa R instalando y donde se irán corriendo paso a paso todos los análisis.
Programa
  • R-studio, conceptos básicos y entorno de trabajo
  • Instalación de librerías de R
  • Filtrado de calidad de lecturas de 16S rRNA mediante la librería dada2 de R
  • Asignación taxonómica de ASVs
  • Análisis de alfa y beta-diversidad
  • Análisis de composición taxonómica
Criterios de evaluación
Se exigirá la asistencia de al menos el 80% de las sesiones presenciales.
Profesorado
  • José Francisco Cobo Díaz. Facultad de Veterinaria. Universidad de León.

  • Coral Barcenilla Canduela. Facultad de Veterinaria. Universidad de León.

  • Elena Fernández Trapote. Facultad de Veterinaria. Universidad de León.
    •
Archivos adjuntos